Оборудование NGC Research Lab
В лаборатории NGC Research Lab вся процедура ПГТ-А проводится строго согласно всем требованиям и стандартам, указанным компанией производителем приборов для секвенирования Illumina, Inc. на наборах VeriSeq PGS Kit RH-101-1001 (96 samples).
Поступившие из эмбриологической лаборатории биопсированные клетки трофэктодермы 5-6 (реже 7-ого) дня развития сразу заносятся в соответствующие протоколы и помещаются в специализированные лабораторные холодильники фирмы Pozis, поддерживающие температуру -20С/-40С, оптимальную для очень длительного хранения данного биоматериала. Перенос биологического материала из эмбриологической лаборатории в лабораторию NGC Research Lab осуществляется строго в специальных крио штативах ISO FREEZE PCR RACKS, что препятствует нежелательной преждевременной разморозки материала.
ОБОРУДОВАНИЕ NGC RESEARCH LAB
ISO FREEZE PCR RACKS, SSI
Перенос биологического материала из эмбриологической лаборатории в лабораторию NGC Research Lab осуществляется строго в специальных крио штативах ISO FREEZE PCR RACKS, что препятствует нежелательной преждевременной разморозки материала.
БАВ-ПЦР-«Ламинар С»
Первый этап процедуры ПГТ-А - полногеномная амплификация биопсированных клеток трофэктодермы (WGA) проводится в специальной лабораторной зоне, так называемой «чистой зоне», где минимизируется любая контаминация при работе с биологическим материалом.
Сама процедура WGA осуществляется в пцр- боксе фирмы Lamsystems, предназначенный для чистой работы с ДНК-пробами при проведении ПЦР – генодиагностики и обеспечивающий защиту рабочего места от внешнего загрязнения.
Приборы, используемые
для постановки WGA
T100 Thermal Cycler
Амплификатор Т100 зарегистрирован на территории Российской Федерации и внесен в Государственный реестр изделий медицинского назначения и медицинской техники.
C1000 Touch Thermal Cycler
Амплификатор C1000 Touch зарегистрирован на территории Российской Федерации и внесен в Государственный реестр изделий медицинского назначения и медицинской техники.
Приготовление библиотек и
запуск секвенирования
На сегодняшний момент в нашей лаборатории приборная база состоит из двух моделей секвенаторов фирмы-производиля Illumina, Inc: MiSeq и MiSeqDX. Обе модели имеют одинаковый функционал и выполняют одни и те же задачи, разница заключается лишь в том, что модель DX имеет регистрационное удостоверение для использования в диагностических целях в США и ЕС. Максимальная загрузка обоих приборов за один запуск – 48 образцов. Общее время работы прибора от момента загрузки готового пула библиотек до импортирования сгенерированных данных с помощью специального программного обеспечения BluFuse составляет около 5ти часов.
Линейка секвенаторов компании Illumina, Inc
Illumina Miseq
Система высокопроизводительного секвенирования Illumina MiSeq основана на методе параллельного секвенирования миллионов фрагментов ДНК с использованием технологии секвенирования на молекулярных кластерах при помощи флуоресцентно меченных нуклеотидных зондов.
Геномная ДНК фрагментируется до размеров 200–1000 п.н. Полученные фрагменты представляют собой основу для создания библиотеки случайных фрагментов, что достигается путем последовательных ферментативных реакций, «пришивки» олигонуклеотидных адаптеров с последующей амплификацией.
Затем последовательности, кластеризованные на чипе в результате ПЦР, детектируются в проточной ячейке системы высокопроизводительного секвенирования Illumina MiSeq при добавлении флюоресцентно-меченных оснований.
Удобный в использовании и компактный прибор включивший в себя генерацию кластеров, амплификацию, секвенирование и анализ данных.
Генетический анализатор 3500 TF
8-капиллярный генетический анализатор Appled Biosystems 3500 устанавливает стандарт в капиллярном электрофорезе. Приборы серии 3500 - это первые генетические анализаторы, разработанные с конкретным набором функций и рабочим процессом для приложения Human Identification. Анализатор сочетает в себе инструмент с реагентами, расходными материалами и программным обеспечением Applied Biosystems, а также ведущую в отрасли поддержку для обеспечения интегрированного решения HID-системы, которое значительно улучшает простоту и эффективность применения.
О нас
-
Фото и видео
